Nadat hem op zijn middelbare school een gênant incident overkomt, verlaat de introverte Jun Sakurada zelden het huis. Op een dag ontvangt hij een brief waarin hem “ja of nee” wordt gevraagd en hij besluit “ja”. Hij ontmoet dan de levende pop Shinku en het verhaal van de originele Rozen Maiden-serie ontvouwt zich.
Maar wat zou er gebeurd zijn als hij ‘nee’ had gekozen? Hoewel hij niet meer zo introspectief is als vroeger, kan Jun zijn plek in de wereld nog steeds niet vinden. Maar wat zal er gebeuren nu Shinku in deze wereld is verschenen waar de ‘Rozen Maiden’ niet eens zou moeten bestaan?